益生菌是通过定殖在人体内，改变宿主某一部位菌群组成的一类对宿主有益的活性微生物。通过调节宿主黏膜与系统免疫功能或通过调节肠道内菌群平衡，从而产生有利于健康作用的单微生物或组成明确的混合微生物。
人体、动物体内有益的细菌或真菌主要有酵母菌、益生芽孢菌、丁酸梭菌、乳杆菌、双歧杆菌、放线菌等。益生菌可合成消化酶，它们与动物体合成的消化酶一起，刺激动物体分泌消化酶，机体中氧化物含有未配对的电子，容易发生氧化还原反应，机体中存在着抗氧化系统，它们不断的清除机体合成的氧化物，维持着氧化物的动态平衡。
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