原生动物的营养方式有植物性营养、动物性营养、腐生性营养三种。
1、植物性营养：原生动物门植鞭毛类体内含有色素体，可利用光能将二氧化碳和水合成糖类，制成自身生长的营养物质。
2、动物性营养：即原生动物通过胞口吞食其他生物或有机碎片，食物由临时性的膜包围形成食物泡，食物泡在细胞质内被消化和吸收。
3、腐生性营养：生物通过体表渗透吸收周围呈溶解状态的有机物，以此补充自身有机质，也称渗透营养。
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